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    美国荷斯坦牛系谱解读

    此文翻译自美国荷斯坦协会网站,加上部分注释说明,

    英文原版址:http://www.holsteinusa.com/pdf/print_material/read_pedigrees.pdf

     

    准确可靠的遗传信息来源

    正式的荷斯坦牛系谱将祖先,生产性能和遗传信息整合成一份方便使用的文档。不管是做配种决定,还是决定一头待售牛只是否值得买入,荷斯坦牛只系谱都会提供给你所需要的牛只信息和细节。

    当你卖牛时,正式的荷斯坦牛只系谱还是核查牛只生产信息和祖先信息的一种方式,提供给潜在客户一份可信的牛只档案,是使客户满意,赢得回头客的第一步。

    便于阅读,评估更有把握

    一页纸的荷斯坦牛系谱包含了大量的重要信息。统一的格式,便于牛只的评估和比较。

    正式的荷斯坦系谱包含任何时候注册荷斯坦牛的多世代信息和生产性能信息。

    正式荷斯坦系谱阅读说明


    系谱包含的信息:

    1

     

    第一行,系谱正中,表示荷斯坦牛只祖先注册百分比(percentage Registered HolsteinAncestry (RHA)),同时表明牛只是北美血统(RHA-NANorth American)还是国际血统(RHA-IInternational)。

    说明:前面的100%表示这头牛的祖先100%都在美国荷斯坦协会注册了。如果不是100%,表示有部分祖先没有在美国荷斯坦协会注册,这并不能表示牛只不是纯种荷斯坦,只是可能系谱不全。


    如上图,这头牛并不是100%,但是TPI仍高达2395,并且产奶量,净效益NM都比较高。

    2

    系谱左上第一个信息块是牛只完整的识别和分类信息,包括牛只的名字,所属的国家,注册号,%RHA信息和遗传编码。

    遗传编码

    遗传编码

    英文全拼

    中文翻译

    BD

    Bulldog1

    犬状公牛症隐性基因携带者1 

    BL

    Bovine Leukocyte Adhesion Deficiency (BLAD)1

    白细胞粘连缺陷病隐性基因携带者1  

    TL

    Tested free of BLAD

    经检测不携带BLAD隐性基因

    BY

    Brachyspina1

    短脊椎综合症

    TY

    Tested free of Brachyspina

    经检测不携带BY基因

    CV

    Complex Vertebral Malformation (CVM)1

    脊柱畸形综合症(CVM)隐性基因携带者

    TV

    Tested Free of CVM

    经检测不携带CVM基因

    DP

    Deficiency of Uridine Monophosphate  

    Synthase (DUMPS)1

     

    尿苷磷酸合成酶缺陷症(DUMPS

    TD

    Tested free of DUMPS

    经检测不携带DUMPS基因

    MF

    Mule-Foot1

    骡蹄症缺陷基因携带者

    TM

    Tested free of Mule-Foot

    经检测不携带MF基因

    PO

    Observed Polled2

    无角显性基因携带者2

    PC

    Tested Heterozygous Polled2

    经检测为杂合无角基因携带者

    PP

    Tested Homozygous Polled

    经检测为纯合无角基因携带者

    TP

    Tested free of the Polled condition (horned)

     

    经检测没有无角情况(有角)

    PT

    Pink Tooth (Porphyria)1

    粉红色牙(卟啉症)

    RC

    Carrier of Red Hair1

    隐形红毛基因携带者

    DR1

    Tested Heterozygous Dominant Red2

    经检测携带杂合红毛基因

    DR2

    Tested Homozygous Dominant Red2

    经检测携带纯合红毛基因

    B/R

    Black/Red1

    褐色/红色毛基因携带者

    TR

    Tested free of Red Hair Color

    经检测不携带红毛基因

    注:1表示隐性基因携带者;2表示显性基因携带者。


    仍以这头注册号为142536386的牛只为例,TL代表不携带BLAD隐性基因,TD表示不携带DUMPS基因。其它的都可以从表中查出。

    体型等级信息位于牛只注册号下面,包括鉴定时的年龄,最终评分,以及主要的级别。目前的体型等级体系开始于200412月,包括五个部分:体躯容量,产奶强度,臀部,肢蹄,乳房系统。2004年12月以前的奶牛体型评分有下划线,包括:体型结构(frame),乳用特征,体躯容量,肢蹄,乳房系统。

    如果牛只被评为E级超过一次,体型等级后面会有多个E

    在这一行还有认证称号如:GMS—金牌父亲,GMD—金牌母亲,DOM—高效益母亲。

     

    注:Front End/Capacity:体躯容量包括前段(前腿直),胸(深而宽),barrel肷窝(长而且相当深和宽),背腰(平直而强壮),体高,品种特征(整体体征和平衡性)。

    Dairy Strength:产奶强度包括肋骨(较宽的开张距离),胸宽(容纳重要器官的容量),前端肋骨的弹性(好的开张度),大腿(倾斜度),肩胛(突出),脖子(长,瘦,融于肩部),后部皮肤(薄,松,柔顺)。

    比如示例系谱中的祖父2124357和祖母14504541,都有下划线。比如祖父出生于1990年,鉴定时间为10岁1个月,即2000年2月份进行的鉴定,+EEP,表示曾经得过2次e,1次P,+号的意思是Good Plus。

    另外,GM原意是金牌,但这里表示的是金牌父亲,因为这是头公牛。

    美国的线性评分体系,90-100分为Excellent,85-89分为Very Good,80-84分为Good Plus,75-79分为Good,65-74分为Fair,64分以下为Poor。

    线性评分与系谱简称对照表

    简写

    全称

    汉语对照

    分数

    E

    Excellent

    优秀

    90-100

    V

    Very Good

    很好

    85-89

    +

    Good Plus

    好+

    80-84

    G

    Good

    75-79

    F

    Fair

    一般

    65-74

    P

    Poor

    50-64

     

    3

    TPI®(Total Performance Index)和名字在同一行。TPI是一个基于平衡性状的选择指数,可以帮助育种人员选择具有提高奶牛群体水平的基因的个体。TPI公式包含以下性状:PTA蛋白,PTA脂肪,PTA体型,STA乳用特征,乳房系统,肢蹄系统,PTA生产寿命,PTA体细胞评分,PTA女儿妊娠率,PTA女儿易产性(顺产率),女儿死亡率。

    在系谱上你会发现TPI有好几种:

    l  PTPI(pedigree TPI:血统TPI)用于(没有经过基因组测定,没有体型评分,没有正式的产奶记录)没有PTA值的年幼或老年牛只;如果是公牛,就是没有任何女儿信息。PTPI的值是父亲和母亲TPI的平均值。

    l  CTPI(cow TPI:母牛TPI);母牛没有经过基因组测定,但是有体型评分,并且有正式的产奶记录(通常意味着参加DHI)。

    l  GTPI(Genomic TPI:基因组TPI)用于经过基因组测定的年只。

    l  TPI:公牛没有经过基因组测定,但是有女儿信息。

    在TPI值之前有一个P5到P9的排名,表示某一年内出生的同一性别的排名前50%的牛只。例如:P9表示在出生那一年排名在90%以上,即属于最好的10%,P8表示在出生那一年的排名80%,即属于最好的20%。仍以母牛号142536586为例,它的P9表示它是2013年出生的母牛中排名前10%的优秀母牛。

     

    附加说明:英文系谱原文没有,但这里必须要讲清楚。在P9后面,跟着一个77K。表示该头牛已经过基因组测定了77K个SNP位点。1k等于1000,即已经检测了7万7千个SNP位点。常见的有3K,6K,9K,50K。值越小,费用越低。

    有时候不是K而是IMP:英文原文是imputed GTPI,表示牛只有足够的后代做了基因组测定,它本身没有做基因组测定,但它的基因型可以同它的后代的遗传进展进行比对。

    有时候会见到HD,全称GGP-HD,表示的是77K的SNP检测,相对的9K及以下的SNP检测称为GGP-LD。目前最高的是800K的SNP检测。

    具体参考荷斯坦协会网介绍:http://www.holsteinusa.com/programs_services/genomics_6k_snp.html

    4

    这个信息块位于右上角,显示的是牛只所有者信息,牛只的出生日期;同时还显示动物的性别,动物所在牧场的ID,或是用于人工输精公牛的短名字。

    5

     

    PTAPredicted Transmitting Ability)预期传递力,后面是动物的识别和分类信息。动物将传递给后代一个可预期的生产力或者体型特征,PTA表示的就是遗传水平的优或劣。通常根据动物的遗传效益,通过PTA值来对动物进行排名。

    第一行:PTA包括奶量(Milk,脂肪(Fat,蛋白(Protein,可靠度(Reliability)。后面是计算PTA的日期。对于年幼动物,利用其双亲PTA的平均值来计算。用#号表示。

    第二行:PTA有净效益(Net merit,以及脂肪和蛋白的PTA%。如果是公牛,会显示女儿在遗传评价中所占的百分比。

    第三行:PTA包括长寿性(Productive life,体细胞分(Somatic Cell Score,女儿妊娠率(Daughter Pregnancy Rate),女儿易产性(DaughterCalving Ease)。

    第四行:PTA包括体型(Type),乳房系统(UdderComposite,肢蹄系统(Feet and Legs Composite)。后面显示体型PTA的可靠度和PTAT的计算日期。

    体型和生产能力的国际遗传评估会在PTA数据上打上标记“MACE YIELD EVALUATION 并且/或者 MACE TYPE EVALUATION”。TPI值会后缀一个M。如果一个外国的体型评估数据通过公式转换为美国的,则PTA数据上将打上标记“CONVERTED TYPE EVALUATION”。这类评估或是基于公式转换,或是跨国评估(MACE:Multiple Across Country Evaluations)。MACE或者公式转换的公牛后代的PTPI值后面会标记一个C或者M,直到美国可以提供信息为止。

    6


    对于母牛,遗传信息后面是生产记录。一行一个检测项目(生产数据开始记录在1997年1月1日之前)或者有三星选项(生产数据记录在1997年1月1日之后);产犊年龄;每天挤奶次数;数据记录天数;产奶量磅;DCRM(产奶量数据收集比例);乳脂率;脂肪量磅;乳蛋白率;蛋白量磅;DCRC(乳成分收集比例)泌乳期校正为305天以后。行的后面如果跟一个“X”,表示记录包含一些极端数据。如果牛的泌乳期超过305天(长达365天)就会有第二行的数据。

    如果奶牛终生产量超过10万磅,系谱上就会显示终生产量(LIFE)。

    在优秀的产量记录下面一行会标出州和国家的最好的奶量,脂肪和蛋白记录。这个认证是基于DHIR和三星记录。

    注:1997年1月1日以后的产量数据进行三星区分,一星*代表Custom(一般),两星**Deluxe(高级),Primier(卓越)。

    检测类型

    检测类型(数据在1997年1月1日之前)

    DHI登记

    DHI协会

    利用时间控制转换AM/PM(指DHI取样)

    APT

    APM

    转换AM/PM乳品样本

    APS

    APC

    不用时间控制转换AM/PM

    APR

    APD

    重量和乳成分一个月测一次

    DHR

    DHI

    三星标签

    Premier

    ***

    卓越

    Deluxe

    **

    高级

    Custom

    *

    一般


    7



    如果产量记录下面还有空间,母牛的记录会显示在这里。国家荷斯坦1st, 2nd, and 3rd获得者会添加到数据库。全美国,全美国后备,以及全美国获得提名的胜者都会收录进数据库。

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